Vizeink jótékony hatásai kémiai és biológiai összetételeikben rejlenek. Az, hogy pontosan melyik gyógyvíz milyen megbetegedés esetén alkalmazható, nagyban függ a kémiai tulajdonságától és az ásványianyag összetételétől.

Leggyakrabban mozgásszervi megbetegedések esetén javasolt a termálvizek alkalmazása, főként idült degeneratív vagy reumatológiai megbetegedésekben, csontritkulásban szenvedőknél, különböző végtagsérülések után, ortopédiai műtéteket követően, protézis-beültetés után, bénulások utókezelésében, gerincsérv esetén. Bizonyos gyógyvizek különböző bőrbetegségek, műtéti hegek gyógyulását is elősegítik, de a víz hőfoka jótékonyan hat az egyes keringési megbetegedések esetén is. Kimutatták, hogy a gyógyvizek felerősítik a gyógyulás folyamatát, a betegek állapota és közérzete javul, és már néhány fürdőzés esetén is megfigyelhető a panaszok csökkenése. Nagyfokú javulás, gyógyulás azonban csak a szakorvos által javasolt kúrák során érhető el.

Annak ellenére azonban, hogy a gyógyvizek rengeteg pozitív tulajdonsággal rendelkeznek, léteznek olyan esetek, olyan megbetegedések is, amikor az orvos nem ajánlja az alkalmazásukat, hiszen sok esetben inkább ronthatják a gyógyulás esélyeit, vagy növelhetik a fertőzésveszély kockázatát.

Magas vérnyomás, vénatágulat, szívelégtelenség, szívroham után három hónapig különösen ellanjavallt a gyógyfürdők használata. Nedvedző bőrsérülés vagy mély sebek esetén sem ajánlott a meleg fürdővíz.